Hast Du die Entladung im Stecker auch auf der intakten Stufe? Wenn keine CCFL dran hängt kann die Ausgangsspannung weit über 2kV liegen, wenn eine dran ist, zündet diese irgendwo zwischen 1 und 2kV und dann bricht die Spannung an dem jeweiligen Ausgang auf <700V zusammen, durch die Ankopplung über recht kleine Kondensatoren ist es direkt am Trafo noch etwas mehr. Mich wundert, dass die Entladung nur den einen Stecker betrifft.
Die Spannungen vor den Drosseln lassen sich nur sinnvoll mit dem Oszi messen.